The post Mobilisatie en gebruik van relevante soortenlijsten voor Nederland via de nieuwe Catalogue of Life Infrastructuur appeared first on NL BIF.

The post Flora Caribisch Nederland appeared first on NL BIF.

The post Van Acheta tot zoemertje: Sprinkhaangeluiden op Xeno-Canto en GBIF appeared first on NL BIF.

De Reptielen en Amfibieën collectie van M.S. Hoogmoed is een belangrijke en goed gedocumenteerde collectie. Deze collectie bestaat uit reptielen en amfibieën uit voornamelijk Zuid-Amerika (nadruk op Amazone), verzameld tussen 1968 en 1999 en is bewaard in alcohol. Een gedeelte van deze collectie is al geregistreerd en geïntegreerd tijdens o.a. het Surinameproject maar een groot aantal objecten staat nog ongeregistreerd in het depot, apart van de systematische collectie. Hierdoor zijn deze objecten niet doorzoekbaar en vragen over deze collectie kunnen niet goed worden beantwoord. Naturalis wil deze collectie
met al zijn informatierijkdom digitaal ontsluiten zodat het beschikbaar komt voor toekomstig onderzoek.

Niet alleen zijn er verzamelgegevens bekend, maar ook de originele veldboeken zijn gedigitaliseerd en zullen gekoppeld worden. Deze veldboeken bevatten uitgebreide beschrijving van locatie, biotoop en uiterlijke kenmerken inclusief tekeningen van oog- en rugpatronen. Daarnaast zijn in het veld dia’s gemaakt en opnames van kwaakgeluiden vastgelegd. Deze bijzondere bronnen zullen opgenomen worden tijdens de digitalisering van de specimens, aangevuld met georeferentie. Tijdens de werkzaamheden worden de specimens ook gefotografeerd, wat ook gekoppeld wordt aan de records. Uiteindelijk zal Naturalis aan GBIF een wetenschappelijk waardevolle dataset opleveren met een rijkdom aan verschillende datatypen.

The post Digitalisering collectie Hoogmoed appeared first on NL BIF.

Het Vogeltrekstation NIOO-KNAW – centrum voor vogeltrek en -demografie coördineert het ringonderzoek aan wilde vogels in Nederland en waarborgt het duurzame beheer van alle ring- en terugmeldgegevens. De gegevenscollectie omvat vele miljoenen vogels, die sinds 1911 in ons land van een ring zijn voorzien. Met die dataset proberen we veranderingen in vogeltrek te signaleren en te verklaren. Ook stellen we veranderingen vast in de overleving en reproductie van vogels, die belangrijke hints kunnen geven over de achterliggende oorzaken van aantalsveranderingen. De data geven ook informatie over de veranderingen in fenologische processen over een tijdschaal die ongeëvenaard is. De gegevens zijn duurzaam vastgelegd in een database, zijn beschikbaar voor analyse en worden gepresenteerd op www.vogeltrekatlas.nl.

Er wordt hard gewerkt aan de volledige digitalisatie van de gegevens, een klus die grotendeels wordt uitgevoerd met vrijwilligers, en die naar schatting in 2023 zal zijn afgerond. Digitaal beschikbaar maken en analyseren van historische datasets is een belangrijke vorm van ‘digitale re-surveying’: het terugkeren naar historische referentiekaders om veranderingen in onze biodiversiteit in hun volle omvang bloot te leggen.

In dit project richten we ons op de digitalisatie van de biometrische gegevens die bij vrijwel elke gevangen vogel gemeten en genoteerd worden. Deze belangrijke aanvullende informatie is voor een groot deel nog niet gedigitaliseerd, terwijl de toepassingsmogelijkheden legio zijn: op gestandaardiseerde wijze en over lange termijn verzamelde biometrische gegevens geven informatie over veranderingen in de lichaamsgrootte en de conditie van vogels, veranderingen in de timing van rui, over geografische variatie en over evolutie. We gaan de gegevens veiligstellen door het invoeren en/of importeren van archieven en datasets en die beschikbaar zijn via de ringers. Na toevoeging aan de centrale database worden tenminste 1 miljoen historische biometrische records en andere aanvullende gegevens uit vogelvangsten geëxporteerd naar NLBIF, met nadruk op de periode 1960-2020 (60 jaar).

The post Lange-termijn dynamiek van lichaamsgrootte bij vogels appeared first on NL BIF.

Abstract: Dit project richt zich op het publiceren van 60.000 records van libellen van Maleisië, Singapore, Brunei, Indonesië, Timor Leste en Papoea-Nieuw-Guinea. Het betreft alle ooit gepubliceerde waarnemingen en omvat 1380 soorten (>20% van de wereldfauna) waarvan meer dan de helft endemisch is voor de genoemde regio. De regio is slecht onderzocht en de gegevens zijn  momenteel alleen in de literatuur beschikbaar. Libellen worden veel gebruikt als indicator voor de kwaliteit van zoetwaterhabitats en zijn in toenemende mate populair bij amateur natuurvorsers in Maleisië, Singapore en delen van Indonesië. De ontsloten gegevens worden gebruikt voor (1) het maken en verbeteren van IUCN assessments van alle soorten uit de regio en (2) voor een wetenschappelijk artikel waarin in kaart wordt gebracht in welke regio’s hoge dichtheden aan bedreigde soorten voorkomen en van welke regio’s geen data voorhanden is.

The post Libellen en de bescherming van zoetwaterhabitats in Maleisië, Indonesië en Papoea-Nieuw-Guinea appeared first on NL BIF.

Abstract: Steekmuggen hebben een enorme impact op mensen vanwege de rol die sommige soorten hebben als vector van pathogenen. Naturalis huisvest een belangrijke steekmuggen-collectie van het Oriëntaalse en Neotropische gebied. Deze collectie werd opgebouwd begin vorige eeuw door Johanna Bonne-Wepster. Haar taxonomisch werk had als doel “de niet taxonomische geschoolde arts de middelen te geven om gevaarlijke steekmuggen te herkennen”. De collectie bevat ongeveer 94.000 exemplaren, waaronder veel typen. De meeste exemplaren zijn geëtiketteerd met slechts een nummer. De nummers corresponderen met informatie in de veldboeken waarin Johanna Bonne-Wepster haar data heeft opgeslagen. De informatie van de veldboeken is digitaal opgeslagen in een Google spreadsheet. De specimens zijn tot op heden niet geëtiketteerd met als gevolg dat de gegevens van de spreadsheet niet geëxporteerd kunnen worden naar het GBIF platform. Hoofddoel van het project is om de data te mobiliseren en beschikbaar te maken voor onderzoek. Echter, hiervoor moet een tweetal beheerstechnische stappen gezet worden: het voorzien van de specimens van 1) etiketten en 2) registratienummers. Naast het mobiliseren van data heeft het project als doel het fotograferen en documenteren van het type materiaal dat aanwezig in de collectie is.

The post Digitalisering collectie Bonne-Wepster appeared first on NL BIF.

Abstract: Het Natuurhistorisch Museum Rotterdam (NMR) is een regionaal natuurhistorisch museum dat focust op de natuur en biodiversiteit van Rotterdam en omgeving. Naast een fysieke collectie van ruim 370.000 monsters beheert het NMR samen met haar onderzoeksafdeling Bureau Stadsnatuur ruim 700.000 waarnemingen van vlinders (nachtvlinders: ruim 600.000; dagvlinders: ruim 100.000), overwegend uit Zuid-Holland, daarnaast Noord-Holland, Noord-Brabant, Utrecht en Gelderland uit de periode 1947-2020. Deze data werden verzameld door citizen scientists en onderzoekers van Bureau Stadsnatuur. Vlinders staan in Nederland (en elders) onder druk. Sinds 1940 is een kwart van de Nederlandse dagvlinders uit ons land verdwenen en Nederlandse nachtvlinderdata vanaf 1980 laten een verontrustend beeld zien met een sterke afname van het aantal individuen van de meeste soorten; bovendien zijn er de afgelopen eeuwen ook soorten verdwenen uit de Nederlandse fauna. Data van voor 1980 zijn voor zowel dag- als nachtvlinders beperkt beschikbaar en maken het lastiger huidige veranderingen te duiden. Historische waarnemingen zoals in dit project zijn dus van cruciaal belang om een beter inzicht te krijgen in een meer natuurlijke situatie van de Nederlandse vlinderfauna. De data zijn (inmiddels) intern digitaal beschikbaar, maar niet samengevoegd, ongesynchroniseerd of gestandaardiseerd en ongecontroleerd. In dit project wordt een FileMaker database (CB 4.0Obs) gebouwd die geschikt is voor waarnemingsdata van nachtvlinders, inclusief gestandaardiseerde taxonomische en georeferenced geografische backbones. Daarna zullen hiermee de ruim 700.000 waarnemingen geëxporteerd worden naar GBIF, waar ze door de hoge kwaliteit van de originele waarnemingen en ontsluiting een rol kunnen spelen bij biodiversiteitsanalyses.

The post Mobilisatie van Nederlandse vlinderwaarnemingen appeared first on NL BIF.

Abstract: De vakgroep dierenoecologie aan de Rijksuniversiteit Leiden heeft in maart 1953  een grootschalig monitoringsonderzoek gedaan in de duinen van Meijendel. Waarschijnlijk was dit wereldwijd het eerste onderzoek met zo’n grote omvang. Honderd vangblikken zijn toen op 33 locaties in 16 verschillende vegetatietypen ingegraven en zo konden op de bodem lopende kleine dieren (evertebraten en kleine vertebraten) worden gevangen. Bij iedere locatie hoorde een permanent kwadraat (PQ plot) waar de vegetatieontwikkeling werd gevolgd.
Over de resultaten van dit onderzoek zijn enkele artikelen verschenen in de ‘Meijendel Mededelingen’ en in een Engels artikel van de hand van drs G.J. de Bruyn uit 1997 (H21 van Dry coastal ecosystems of the world). Nu zijn de gegevens die in dit onderzoek zijn verzameld niet publiek beschikbaar, maar wel in mappen op papier. Deze mappen uit het archief van drs G.J. de Bruyn bevatten in ieder geval de loopkevers. Het doel van dit project is om de gegevens van een continue vangreeks 1953-1959 uit Meijendel die nu alleen op papier beschikbaar zijn, digitaal beschikbaar te maken. Het gaat om het ontsluiten van deze unieke dataset waarvoor de metadata bestaan uit de volgende onderdelen (1) een kaart met de locatie van alle vangblikken, (2) een beschrijving van de vegetatie rond de vangblikken, (3) zwart-wit foto’s van alle locaties van de vangblikken, en (4) gedetermineerde specimen in de vangsten. Met het digitaal beschikbaar komen van deze gegevens hebben we een nulmeting voor deze soorten in de duinen van Wassenaar. Bovendien opent dit direct de mogelijkheid om de achteruitgang in de insecten/ ongewervelden in dit deel van Nederland te verifiëren en te onderbouwen.

The post Gegevens van het Meijendelonderzoek uit 1953-1960 appeared first on NL BIF.

Abstract: FLORON en Naturalis werken samen aan een verdere ontsluiting van de Nederlandse Botanische Collectie die door Naturalis in de databank BRAHMS wordt beheerd. Enkele jaren geleden heeft Naturalis bijna een half miljoen herbariumvellen gescand van vrijwel alle ooit in Nederland verzamelde wilde planten. Ook zijn de soortnaam, datum, locatiebeschrijving en verzamelaar gedigitaliseerd. De dataset is in GBIF ontsloten en wordt met enige regelmaat geactualiseerd. Om de bruikbaarheid van deze gegevens verder te vergroten, worden in dit project geografische coördinaten aan de locatie toegevoegd. Hierbij wordt het mogelijk om de gegevens op een kaart te bekijken. Met slimme geocoding tools wijzen we aan elk herbariumvel een voorlopige coördinaat toe. Hiervoor worden onder meer historische waarnemingen en toponiemen uit de Nationale Databank Flora en Fauna gebruikt. Vervolgens vragen we vrijwilligers om de locatie te controleren en te verbeteren. Dat houdt in: het met uitsluitend een locatienaam opsporen van terreinen die botanisch interessant waren, maar nu soms niet meer bestaan. Na afronding van het project worden de locatiegegevens aan GBIF toegevoegd, waardoor gegevens een grote meerwaarde krijgen voor onderzoekers. Tevens is dit het sluitstuk van het beschikbaar maken van verspreidingsgegevens van planten in de Nationale Databank Flora en Fauna. Na afronding zijn 90% van alle ooit in Nederland verzamelde plantencollecties digitaal beschikbaar voor overheden, natuurbeschermingsorganisaties en onderzoekers in Nederland en wereldwijd. Dit project is een vervolg op de eerste fase die in 2019 startte.

The post Botanische Collectie op de Kaart appeared first on NL BIF.