Onder leiding van Stichting Xeno-canto, in samenwerking met de University of Dar es Salaam (UDSM), Kumbe Biodiversity Limited en DIKW Consulting, ontsluit dit project 750 tot 950 digitale veldopnames van Tanzaniaanse amfibieën—waaronder bedreigde, endemische en nog niet beschreven soorten.

De Eastern Arc-bergketen en de kustbossen van Tanzania zijn cruciale mondiale biodiversiteitshotspots die ernstig worden bedreigd door ontbossing. Hoewel deze gebieden onderdak bieden aan vier van de tien meest bedreigde amfibiëngenera in Afrika, zijn hun geluiden nauwelijks vertegenwoordigd in open-access bioakoestische databanken.

Het projectteam gaat historische en recente geluidsopnamen standaardiseren, voorzien van verrijkte metadata en publiceren via Xeno-canto en GBIF. Daarnaast wordt “FrogNet” ontwikkeld: een open-source AI-herkenningsmodel dat specifiek is afgestemd op amfibiëngeluiden uit Tanzaniaanse ecosystemen. Door studenten van UDSM actief te betrekken bij de annotatie van data en het trainen van het AI-model, bouwt het project aan duurzame lokale expertise voor bioakoestisch onderzoek en natuurbescherming in Oost-Afrika.

Foto: Ardgard Essau Mwamgeni (CC-BY)

The post Giving a voice to Tanzanian amphibians appeared first on NL BIF.

Natuurmuseum Fryslân ontsluit met Insecta Frisica ruim 104.000 insectenrecords uit de eigen collectie via NLBIF/GBIF. Zo worden meer dan 100 jaar aan gegevens over de entomologische biodiversiteit van vooral Fryslân en Noord-Nederland duurzaam toegankelijk voor onderzoek, beleid en natuurbeheer.

De entomologische collectie van Natuurmuseum Fryslân omvat ruim 113.000 exemplaren, waaronder meer dan 60.000 records uit Fryslân, maar deze gegevens zijn nog niet breed digitaal ontsloten. Juist historische collectiedata zijn nodig om veranderingen in verspreiding en biodiversiteit door de tijd te kunnen volgen en actuele waarnemingen van een betrouwbaar ecologisch referentiekader te voorzien.

Insecta Frisica registreert, controleert en schoont de collectiedata op, vertaalt deze naar de DarwinCore-standaard en publiceert ze via een eigen NMF-portal binnen NLBIF. Daarmee worden ruim 104.000 records duurzaam en herbruikbaar beschikbaar, inclusief gegevens van zeldzame, teruggelopen en invasieve soorten, en ontstaat een blijvende basis voor verdere digitalisering van de natuurhistorische collectie.

The post Insecta Frisica appeared first on NL BIF.

Grauwe Kiekendief – Kenniscentrum Akkervogels (GKA) voegt een historische reeks veldgegevens toe aan GBIF. De data betreffen de monitoring van veldmuizen en andere muizensoorten met klapvallen in agrarische gebieden in Nederland en Duitsland in de periode 1992-2016.

Muizen spelen een belangrijke rol in het voedselweb van het boerenland. Ze vormen het stapelvoedsel voor roofdieren zoals kiekendieven, torenvalken en velduilen. Veranderingen in muizendichtheden hebben daardoor directe gevolgen voor broedsucces, verspreiding en overleving van deze soorten. Omdat aantallen veldmuizen sterk kunnen fluctueren in ruimte en tijd is een langetermijnreeks van muizenmonitoring ecologisch zeer waardevol.

Dit project garandeert het behoud van deze waardevolle data. Inzichten kunnen bijdragen aan de ontwikkeling van maatregelen om het voedselaanbod voor kwetsbare roofvogelsoorten te verbeteren. Ook kunnen de gegevens worden gebruikt om het broedsucces van roofvogelsoorten te verklaren en te voorspellen.

Foto: Jan Ploeger (CC BY-SA 4.0)

The post Verwerking en publicatie van historische gegevens muizenmonitoring appeared first on NL BIF.

Safer and Sounder zal de bestaande Camera Trap Data Package (Camtrap DP) standaard uitbreiden voor bio-akoestische data.

Bio-akoestische data wordt steeds meer verzameld, maar uitwisseling en publicatie naar Global Biodiversity Information Facility (GBIF) worden sterk bemoeilijkt door het ontbreken van een breed gedragen standaard. Dankzij een eerder pilootproject Safe and Sound weten we dat de vraag naar deze standaard groot is en ligt de inhoudelijke basis al klaar.

In dit project streven we via openbare discussies op GitHub community-consensus te bereiken over de nodige aanpassingen aan de standaard. Om adoptie te bevorderen, zullen we essentiële softwaretools aanpassen voor Camtrap DP v2, waaronder camtrapdp, Agouti, GBIF IPT en Wild Album. Het eindresultaat is in een nieuwe versie van Camtrap DP (v2) die bio-akoestische data volledig ondersteunt.

Foto: Julia Wiel CC BY 4.0

The post Safer and Sounder – Extending Camtrap DP for the exchange of bioacoustics data appeared first on NL BIF.

De Bryologische en Lichenologische Werkgroep (BLWG) gaat collecties en waarnemingen uit enkele privéherbaria mobiliseren  via het netwerk van GBIF.

Veel taxonomisch en verspreidingsonderzoek aan flora en fauna wordt in Nederland gedaan door amateuronderzoekers. Zij bezitten soms zeer omvangrijke herbariumcollecties en waarnemingen die opgebouwd werden in een tijd dat biodiversiteitsdata nog schaars was. In Nederland verzamelde gegevens zijn doorgaans al gedigitaliseerd en ontsloten in de Nationale Databank Flora en Fauna en GBIF. Gegevens uit het buitenland zijn meestal niet ontsloten.

In dit project mobiliseren we twee privécollecties met tienduizenden herbariumexemplaren en honderdduizend waarnemingen. We controleren de gegevens wanneer er twijfel bestaat over de determinatie of wanneer een soort voor het eerst in een land wordt gemeld. Daarna publiceren we ze via de IPT van de NDFF Verspreidingsatlas. Het resultaat is een flinke toename van het aantal gegeorefereerde waarnemingen van korstmossen uit de periode 1990-2015.

Foto: Harold Timans (CC BY-SA 4.0)

The post Mobilisatie van Europese waarnemingen en collecties van korstmossen appeared first on NL BIF.

Equatoriaal-Guinea beschikt over een grote rijkdom aan biodiversiteit, maar het ontbreekt momenteel aan de nodige datainfrastructuur. Biodiversity Information for Development (BID), een programma van GBIF,  helpt landen zoals Equatoriaal-Guinea om hun capaciteit voor het verzamelen en delen van biodiversiteitsdata te vergroten. Dit is van cruciaal belang voor de beschikbaarheid van open biodiversiteitsdata.

De rol van Naturalis zal bestaan uit het ondersteunen van de lokale capaciteitsopbouw op het gebied van beheer en analyse van biodiversiteitsdata in Equatoriaal-Guinea via training en coaching. Ook zal de samenwerking tussen de Universidad Nacional de Guinea Ecuatorial (UNGE) en Naturalis worden versterkt. Luis Valente (groepsleider Biodiversity Hotspots bij Naturalis) werkt al lange tijd aan een gezamenlijk project met de UNGE, samen met BID-projectleider Maximiliano Fero, om de lokale biodiversiteit van het eiland Bioko te onderzoeken en beschermen.

Naturalis zal helpen om de initiatieven rondom biodiversiteitsdata in Equatoriaal-Guinea te verbinden met het bredere GBIF-netwerk, en zal van onderzoekers uit Equatoriaal-Guinea leren over de uitdagingen van het verzamelen van biodiversiteitsdata in het veld in de tropische bossen van West-Afrika.

Klik hier voor meer informatie.

Coverfoto: Bioko montane kameleon (Trioceros feae), Chris Quirin (CC BY-NC 4.0)

The post Advancing biodiversity data from Equatorial Guinea appeared first on NL BIF.

Sensing Clues verbindt zijn wereldwijde biodiversiteitsplatform met GBIF, waardoor natuurbeschermingsorganisaties in Zambia, Tanzania, Roemenië, Slowakije en daarbuiten hun biodiversiteitsgerelateerde waarnemingen kunnen delen met een bredere gemeenschap.

Natuurbeschermers en onderzoekers verzamelen wereldwijd enorme hoeveelheden biodiversiteitswaarnemingen. Maar veel van deze data blijven opgesloten in de systemen van afzonderlijke organisaties. Hierdoor worden waardevolle veldwaarnemingen niet gedeeld via GBIF, vooral uit ondervertegenwoordigde regio’s zoals delen van Afrika en Oost-Europa.

Dit project ontwikkelt een Sensing Clues-GBIF Data Sharing Wizard waarmee partners hun waarnemingen kunnen filteren, formatteren, standaardiseren en automatisch publiceren via een koppeling met het GBIF-platform. Organisaties in landen als Zambia, Tanzania, Roemenië en Slowakije publiceren hun eerste dataset en de oplossing wordt beschikbaar voor iedereen die data verzamelt met Sensing Clues.

The post Van veldobservatie naar GBIF: data-koppeling vanuit het Sensing Clues platform appeared first on NL BIF.

Stichting Bargerveen zet, in samenwerking met Adviseur Water en Natuur, bestaande sieralgengegevens van lange waarnemingsreeksen (1916 – 2014) uit drie vennen om in GBIF-format.

In de jaren zeventig en tachtig van de vorige eeuw kampte Nederland met ernstige verzuring. Daarom zijn de sieralgen van drie vennen van 1978 tot en met 2014 jaarlijks bemonsterd op sieralgen. Van deze vennen zijn ook sieralgengegevens uit de periode 1916-1929 bekend. Sieralgen reageren snel op veranderende omstandigheden en vormen een uitstekende indicatorgroep voor verzuring en eutrofiëring. Ze zijn ook indicatoren voor bijzondere natuurwaarden.

De effecten van vermesting, verzuring en klimaatopwarming zijn terug te zien in de soortensamenstelling van sieralgen in de vennen. Door deze data breder toegankelijk te maken, kunnen onderzoekers en beleidsmakers veranderingen in de biodiversiteit beter begrijpen en effectievere maatregelen nemen om de gezondheid van de vennen te behouden en te herstellen.

The post Ontsluiting en mobilisatie van biodiversiteitsdata van sieralgen appeared first on NL BIF.

Het project Landelijk wantsenbestand richt zich op de mobilisatie van 435.000 waarnemingen van Nederlandse wantsen die nog niet digitaal beschikbaar zijn. Na uitvoering van dit project zijn er 1.1 miljoen Nederlandse wantsenwaarnemingen beschikbaar. Dit maakt Nederland tot een van de beste op-wantsen-onderzochte landen ter wereld.

In de afgelopen 50 jaar is er, grotendeels door het werk van Berend Aukema, een omvangrijk bestand met waarnemingen van Nederlandse wantsen opgebouwd. Deze waarnemingen zijn gebruikt voor een serie verspreidingsatlassen en voor de website Nederlandse wantsen. Ongeveer 60% van deze waarnemingen zijn publiek toegankelijk, maar 435.000 waarnemingen afkomstig uit gedigitaliseerde collecties, literatuur en veldwerk, zijn onderdeel van een privé bestand.

Tijdens het project Landelijk wantsenbestand worden de nog niet publiek beschikbare waarnemingen gecontroleerd, wordt de metadata aangevuld, de taxonomie gestandaardiseerd en wordt het gehele bestand gereed gemaakt voor upload naar GBIF. En wordende  veranderingen in de wantsenfauna over de afgelopen 50 jaar beschreven, met aandacht voor de kolonisatiesnelheid van de vele zuidelijke en exotische nieuwkomers.

The post Landelijk wantsenbestand appeared first on NL BIF.

Natuurhistorisch Museum Rotterdam maakt verspreidingsgegevens van mijten en andere parasieten openbaar op basis van de gegevens uit de collectie van Annelies van Bronswijk. Deze informatie kan gebruikt worden voor biodiversiteitsonderzoek naar groepen waar weinig data van beschikbaar is.

Op GBIF zijn van Nederland en omstreken nog maar 22.309 records van mijten vindbaar, terwijl dit een grote en biodiverse diergroep met soorten die schadelijk zijn voor de menselijke en dierlijke gezondheid. Meer FAIR-beschikbare verspreidingsdata van verschillende soorten mijten helpen deze minder knuffelbare dieren mee te nemen bij het beschermen van biodiversiteit.

De collectie bevat 30.000 slides, voornamelijk met mijten, maar ook andere kleine parasieten. Het Natuurhistorisch verwacht in dit project ongeveer 50% van de collectie te kunnen digitaliseren, en belangrijk voorwerk te doen voor versnelde digitalisering van de rest.

The post Mobilisatie van collectie geprepareerde mijten en andere parasieten appeared first on NL BIF.