GULLIVER zal meeuwenbewegingsgegevens openbaar maken, namelijk GPS-gegevens van de Universiteit van Amsterdam (UvA) en ringgegevens van het Instituut voor Natuur- en Bosonderzoek (INBO). Het project bouwt voort op het succes van het eerdere NLBIF-gefinancierde MOVE2GBIF. In dat project ontwikkelden INBO en partners de methode en software om GPS-zendergegevens uit Movebank te vertalen naar het Darwin Core formaat. De aanpak van MOVE2GBIF wordt inmiddels gezien als een aanbevolen standaard voor het publiceren van GPS-zendergegevens.

Met GULLIVER tillen we deze aanpak naar een hoger niveau. We publiceren vijf datasets die samen de bewegingen van meer dan 13.000 meeuwen beschrijven. Het gaat om:

• 4 datasets met GPS-zendergegevens (uit UvA-BiTS), samen goed voor ruim 17 miljoen locaties.
• 1 dataset met meldingen van geringde individuen (uit CR-birding), met meer dan 189.000 waarnemingen van meeuwen met een kleurring.

We zullen deze gegevens op vier platforms publiceren: Movebank, Zenodo, Global Biodiversity Information (GBIF) en Ocean Biodiversity Information System (OBIS). Zo wordt de informatie over de verplaatsingen van meeuwen toegankelijk voor een groter publiek en kan dit gebruikt worden voor breder biodiversiteitsonderzoek. We zullen eveneens een model publiceren dat gedragsclassificaties van de meeuwen kan genereren op basis van acceleratiegegevens. Om de publicatie van deze data semi-geautomatiseerd, reproduceerbaar en voor anderen herbruikbaar te maken, gebruiken en verbeteren we hiervoor het R pakket movepub.

Tenslotte zullen we dit werk beschrijven in een open access data paper, inclusief de datasets, de methoden en de gebruikte software. Zo maken we de gegevens niet alleen beschikbaar, maar ook vindbaar en citeerbaar.

The post GULLIVER appeared first on NL BIF.

Het doel van ‘Fase 2’ is dan ook het verder digitaliseren, structureren en publiceren van deze  waardevolle gegevens, die essentieel zijn voor lange termijn biodiversiteitsonderzoek. De focus ligt op insecten in de ordes kevers en vliesvleugeligen.

Het project legt de basis voor bredere datamobilisatie in Noord-Brabant. Hiermee draagt het structureel bij aan onderzoek, beleid en behoud van biodiversiteit. 

The post Fase 2 van het mobiliseren van biodiversiteitsdata in Noord-Brabant appeared first on NL BIF.

Het project zal focussen op 1) de standaardisatie en verrijking van gegevens uit de fossielencollectie volgens GBIF-data quality requirements, met hoge taxonomische, temporele en geografische precisie, en op 2) de capaciteit en expertise binnen de afdeling Wetenschap te vergroten voor duurzame datamobilisatie naar GBIF vanuit Teylers Museum.

Het project zal door een externe paleontoloog en een registratiemedewerker worden uitgevoerd in nauwe samenwerking met de conservator en beheerders van de afdeling Wetenschap. Aan het eind van het traject is de kwaliteit van de collectiedata verbeterd en de gegevens zijn vrij toegankelijk voor (her)gebruik in wetenschappelijk onderzoek.

The post Data mobilisatie en capacity building bij Teylers Museum appeared first on NL BIF.

Abstract:

Movebank is een wereldwijd platform voor het beheren, delen en archiveren van data van gezenderde dieren. Movebank bevat ruim 2,5 miljard posities, die gezamenlijk de bewegingen van meer dan duizend taxa in zesduizend studies beschrijven, en dagelijks komen er ongeveer 3 miljoen nieuwe records bij. Gegevens in Movebank volgen alle hetzelfde datamodel, wat het mogelijk maakt deze op uniforme wijze te downloaden en analyseren. Deze schat aan gegevens wordt intensief gebruikt binnen de bewegingsecologie, maar wordt nauwelijks gebruikt als bron van algemene verspreidingsdata. Movebank data zijn namelijk niet vindbaar of toegankelijk via het Global Biodiversity Information Facility (GBIF).

Het doel van dit project is om een ​​open source workflow te ontwikkelen om GPS-zendergegevens van dieren in Movebank toegankelijk te maken voor de GBIF-gemeenschap. Deze workflow zal bestaan ​​uit richtlijnen en software om semi-geautomatiseerde publicatie van Movebank-gegevens naar GBIF mogelijk te maken. We zullen deze testen door een reeks datasets van het Nederlands Instituut voor Ecologie (NIOO-KNAW), Sovon en het Instituut voor Natuur- en Bosonderzoek (INBO) te publiceren op GBIF. De resultaten zullen zowel bruikbaar zijn voor het publiceren van andere Movebank studies, als het publiceren van andere sensorgegevens op GBIF. Concreet zullen we:

1. Vijf NIOO-KNAW studies met GPS-zendergegevens van vogels als open data publiceren in Movebank.
2. Richtlijnen en software ontwikkelen voor het standaardiseren en publiceren van dergelijke data vanuit Movebank op GBIF.
3. Data van elf Movebank studies publiceren als datasets op GBIF.

Het project wordt gecoördineerd door Radboud Universiteit.

The post MOVE2GBIF – GPS-zendergegevens van dieren mobiliseren naar Movebank en GBIF appeared first on NL BIF.